Investigation of Yersinia ruckeri infection in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum 1792) Farms by polymerase chain reaction (pcr) and bacteriological culture

Abstract

Bu çalışma, Elazığ ve Malatya illerindeki gökkuşağı alabalığı yetiştirme çiftliklerinde Enterik Kızıl Ağız hastalığına neden olan Yersinia ruckeri etkeninin varlığını incelemek amacıyla gerçekleştirilmiştir. Bu amaçla, çiftliklerden toplanan genç ve yetişkin gökkuşağı alabalıklarınının kan ve bağırsak örnekleri ile balıkların bulunduğu havuz suyu örnekleri bakteriyolojik kültür ve spesifik polimeraz zincir reaksiyonu ile kıyaslanarak incelenmiştir. Y. ruckeri 17 çiftliğin sekizinden izole ve identifiye edilirken, alabalık çiftliklerinde %52.9 oranında tespit edildi. Hastalık Elazığ’daki altı çiftliğin beşinde gözlenirken, Malatya’da lokalize olan 11 çiftliğin üçünde gözlendi. Etken sadece genç balık üretimi yapan altı çiftliğin beşinde tespit edildi. Balık düzeyinde etken izolasyon oranları; yetişkin balıklarda %25.7 (131/510), genç balıklarda %31.7 (19/60) olarak bulunurken, toplamda %26.3 (150/570) oranında saptandı. İzolatların tamamı tür spesifik PCR ile Y. ruckeri olarak başarılı bir şekilde identifiye edilmiş, su örneklerinde ise etken izolasyonu gerçekleştirilememiştir. Sonuç olarak, çalışma bölgesindeki balık çiftliklerinde Y. ruckeri infeksiyonunun balık çiftliklerinde önemli bir düzeyde seyrettiği tespit edildiğinden ERM hastalığından dolayı meydana gelebilecek ekonomik kayıpları azaltmak için acil olarak gerekli önlemler alınmalıdır. Bakteriyel etkenlerin hızlı bir şekilde identifikasyonu için başarılı bir şekilde kullanılabilen PCR sayesinde, su ürünlerinde infeksiyöz hastalıkların yayılmasının önlenmesine yardımcı olunabilecek ve balıkçılık sektörünün üretkenliğine katkıda bulunulabilecektir.

This study has been carried out to investigate the presence of Yersinia ruckeri, the causative agent of Enteric Red Mouth (ERM) disease, in rainbow trout fish breeding farms located in Elazig and Malatya provinces in Eastern Turkey. For this purpose, bacteriological culture and a specific polymerase chain reaction (PCR) have been compare with examine blood and intestine samples collected from adult and young rainbow trout fish as well as water samples collected from all the farms. Y. ruckeri was isolated and identified from eight of the 17 fish farms giving a proportion of 52.9% at fish farm. The disease was noted in five of the rainbow trout farms located in Elazig and three of the 11 rainbow trout farms located in Malatya. The agent was detected in five of the six young fish breeding farms. The isolation percentages of the causative agent at fish level were calculated as 25.7% (131/510) in adult and 31.7% (19/60) in young fish, giving an overall proportion of 26.3% (150/570). All the isolates have been successfully identified as Y. ruckeri by species-specific PCR. No isolation could be made from water samples. It is therefore concluded that Y. ruckeri infection poses a significant threat to the fish farms in the study area and necessary precautions should urgently be taken in order to minimize economical losses due to ERM disease. A specific PCR can be utilized successfully in aquaculture for rapid identification of bacterial agents which will help to prevent spread of infectious diseases and will therefore contribute to the productivity of fishery sector.