Türkiye'de 2014 Yılı İçinde İzole Edilen Karbapeneme Dirençli Escherichia coli ve

Abstract

Tüm dünyada Enterobacteriaceae ailesi üyeleri arasında çoklu ilaç direncine sahip izolatlar artış göstermekte ve tedavide son seçenek olarak kabul edilen karbapenemlere karşı bu izolatlarda bulunabilen karbapenemazlar tedavide başarısızlıklara yol açabilmektedir. Bu enzimlerin ülkemizdeki sıklıklarına ilişkin çok merkezli çalışmalar bulunmamaktadır. Bu çalışmanın amacı, European Survey on Carbapenemase Producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE) projesi kapsamında, Türkiye'nin değişik bölgelerindeki merkezlerden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae izolatlarında karbapenemaz varlığını ve enzim tiplerini belirlemektir. Türkiye'de belirlenmiş 18 merkezden Kasım 2013 tarihinden itibaren ilk altı aylık süre içinde karbapenem grubu antibiyotiklerden (imipenem, meropenem veya ertapenem) en az birine dirençli olarak saptanan ilk 10 klinik izolat koordinatör merkeze gönderilmiştir. İzolatlarda imipenem, meropenem ve ertapenem antibiyotik duyarlılıkları mikrodilüsyon yöntemi ile EUCAST standartlarına göre araştırılmış ve karbapenemaz varlığı fenotipik olarak kombinasyon sinerji testi ile doğrulanmıştır. Karbapenemaz tipleri, VIM, IMP, NDM, KPC ve OXA-48 karbapenemaz genlerine özgül primerler kullanılarak multipleks-polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile araştırılmıştır. Altı aylık süre içinde, koordinatör merkeze, karbapenemaz varlığı şüpheli 155 klinik izolat [21'i (%13.5) E.coli, 134'ü (%86.5) K.pneumoniae] gönderilmiştir. E.coli izolatlarının 19'unda (%90.5) ve K.pneumoniae izolatlarının 124'ünde (%92.5) olmak üzere toplam 155 izolatın 143'ünde (%92.3) genotipik olarak en az bir karbapenemaz geni saptanmıştır. Bu enzimler 136 izolatta tek başına (OXA-48: %84.6; NDM: %6.3; VIM: %2.8; IMP: %1.4) bulunurken, yedi izolatta iki enzim bir arada (OXA-48 + NDM: %2.1; OXA-48 + VIM: %2.1; VIM + NDM: %0.7) olarak tespit edilmiştir. İzolatların hiç birinde KPC enzimi gözlenmemiştir. Mikrodilüsyon testi sonuçlarına göre OXA-48 pozitif izolatların imipenem, meropenem ve ertapeneme direnç yüzdeleri sırasıyla %59.5, %52.9 ve %100 olarak belirlenmiştir. Karbapenemaz varlığının doğrulanması için yapılan kombinasyon sinerji testinin moleküler test ile %100 uyumlu olduğu saptanmıştır. OXA-48 enzimi içeren izolatların birçoğunun meropeneme duyarlı ancak tamamının ertapeneme dirençli olması nedeniyle, karbapenemaz taramasında ertapenemin en uygun antibiyotik olduğu, ekipman ve maliyet gerektiren moleküler yöntemlerin uygulanamadığı merkezlerde sinerji tekniğine dayalı bu fenotipik yöntemin güvenle kullanılabileceği sonucuna varılmıştır

Carbapenems are the choice of treatment in infections caused by multidrug resistant Enterobacteriaceae. In recent years carbapenem-resistant Enterobacteriaceae isolates due to carbapenemases have been increasingly reported worldwide. Multicenter studies on carbapenemases are scarce in Turkey. The aim of this study was to determine the distribution of carbapenemases from different parts of Turkey as a part of the European Survey of Carbapenemase Producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE) project. Beginning in November 2013, carbapenem-resistant isolates resistant to at least one of the agents, namely imipenem, meropenem, and ertapenem were sent to the coordinating center. Minimum inhibitory concentrations for these carbapenems were determined by microdilution tests following EUCAST guidelines. Production of carbapenemase was confi rmed by combination disk synergy tests. Types of carbapenemases were investigated using specifi c primers for VIM, IMP; NDM, KPC and OXA-48 genes by multiplex polymerase chain reaction. In a six month period, 155 suspected carbapenemase-positive isolates were sent to the coordinating center of which 21 (13.5%) were E.coli and 134 (86.5%) were K.pneumoniae. Nineteen (90.5%) strains among E.coli and 124 (92.5%) strains among K.pneumoniae were shown to harbour at least one carbapenemase gene by molecular tests, with a total of 92.3% (143/155). Carbapenemases were determined as a single enzyme in 136 strains (OXA-48: 84.6%; NDM: 6.3%; VIM: 2.8%; IMP: 1.4%) and as a combination in seven isolates (OXA-48 + NDM: 2.1%; OXA-48 + VIM: 2.1%; VIM + NDM: 0.7%). KPC was not detected in any of the isolates. According to the microdilution test results, resistance to imipenem, meropenem and ertapenem in OXA-48 isolates were 59.5%, 52.9% and 100%, respectively. The combination disk synergy test was 100% compatible with the molecular test results. As most of the OXA-48 producing isolates were susceptible to meropenem but all were resistant to ertapenem, ertapenem seems to be the most sensitive agent in screening carbapenemases in areas where OXA-48 is prevalent and phenotypic combination tests can be useful in centers where molecular tests are not available