Yazar "Üngördü, Ayhan" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 5 / 5
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Antioxidant activities of Alyssum virgatum plant and its main components(Springer, 01.02.2022) Koç, Emre; Üngördü, Ayhan; Candan, FerdaThe antioxidant properties of methanol extract of above-ground parts of Alyssum virgatum, an endemic plant, were analyzed. Together with their total phenolic, flavonoid, and antioxidant capacities, their effects on reactive oxygen species were determined by experimental methods. The methanol extracts of A. virgatum plant appeared to exhibit in-vitro antioxidant activity. In particular, the extract of the plant was found to have a scavenging effect against hydrogen peroxide and hydroxyl radical. Total phenolic content was found to be 161.25 mg gallic acid per gram dry material. Total flavonoid content was found to be 119.89 mg quercetin per gram dry material. Total antioxidant capacity was determined as 94.92 mM α-tocopherol acetate per gram dry material. Moreover, the amount of the extract that caused 50% inhibition of hydrogen peroxide and hydroxyl radical was assayed as 29.24 mg mL− 1 and 46.04 mg mL− 1, respectively. Addition to the experimental studies, DFT, molecular docking, and ADME calculations were performed to determine antioxidant, biological activity, and drug properties of two main phenolic components of A. virgatum which are cinnamic acid and ferulic acid. DFT calculations were executed at B3LYP/6–311 + + G(d,p) level in Gaussian 16 software. The HAT, SET-PT, SPLET mechanisms, and the spin density analyses of the main components were investigated in detail. Molecular docking studies of the investigated main components were executed on the antioxidant proteins in Schrodinger 2020–3 program. Additionally, ADME properties of the mentioned main components were determined via QikProp module in the Schrodinger software. All theoretical studies showed that ferulic acid had better antioxidant, biological, and drug activities than cinnamic acid.Öğe Bazı DNA baz çiftleri ile geçiş metal komplekslerinin DFT yöntemiyle iletkenlik hesaplamaları(Cumhuriyet Üniversitesi, 2017) Üngördü, Ayhan; Tezer, NurtenBu çalışma, bazı DNA baz çiftleri ile geçiş metal komplekslerinin iletkenlikleri üzerinedir. Çalışmada doğal ve yapay DNA bazları kullanılmıştır. Doğal DNA bazı olarak guanin, timin ve urasil; yapay DNA bazı olarak da hidroksipridon bazı seçilmiştir. Bu bazların önce dimer yapıları daha sonra metalleşmiş kompleksleri incelenmiştir. Metal olarak 2+ değerlikli Cu2+, Ni2+, Pd2+, Pt2+, Zn2+, Cd2+ ve Hg2+ iyonları seçilmiştir. Oluşturulan baz çiftleri ile komplekslerinin geometrik parametreleri (bağ uzunlukları, açıları gibi) ve enerji değerleri (HOMO, LUMO, Gibbs serbest enerjisi gibi) hesaplanmıştır. Daha sonra DFT yöntemiyle, Band Teorisinden yararlanarak baz çiftleri ile komplekslerinin elektriksel iletkenlikleri nitel olarak tahmin edilmiştir. Baz çiftlerinin tamamının yalıtkan ve Cu-merkezli baz çifti komplekslerinin iletkenliğin iyi olduğu görülmüştür. Bu çalışmanın, DNA nanoteknoljisin gelişimiyle beraber gelecekte yapılacak olan DNA temelli nanoelektronik devrelerin hazırlanması öncesinde öngörüler sunacağı düşünülmektedir.Öğe Fe2(CO)4(?5-C5H5)2 kompleksinin 13C-izotopomerlerinin karbonil gerilme bölgesindeki titreşim spektrumlarının analizi(Cumhuriyet Üniversitesi, 2007) Üngördü, Ayhan; Kaya, CemalMetal karboniller ve türevlerinin organometalik bileşiklerin sentezinde başlangıç maddesi, organik tepkimelerde katalizör olarak kullanılmaları nedeniyle yapılarının aydınlatılması çalışmaları önemli bir araştırma konusu olmuştur. Metal karboniller ve türevlerinin C-O gerilme bandlarının sayısı, şiddeti ve frekansı molekülün yapısı ile doğrudan ilişkilidir. Bu nedenle infrared spektroskopisi metal karbonillerin stereokimyasının incelenmesinde yaygın olarak kullanılmaktadır. Metal karbonillerin katalizör olarak kullanıldıkları tepkimelerdeki ara ürünlerin stereokimyası incelenerek mekanizmalar önerilebilmekte ve başlangıç maddesi olarak kullanıldıkları organometalik bileşiklerin geometrisi saptanabilmektedir. Metal karbonillerin titreşim spektrumlarının analizi için gerekli olan kuvvet sabitlerinin hesaplanmasında deneysel veriler her zaman yeterli değildir. Böyle durumlarda yaklaşık yöntemler kullanılmıştır. Yaygın olarak kullanılan yöntem enerji ayırımlı kuvvet alanları yöntemidir ve bu yöntemin metal karbonillere uygulanması CO-ayırımlı kuvvet alanları yöntemi olarak bilinir. Bu yöntemin uygulanmasında sadece C-O gerilme kuvvet sabitleri ve CO-CO etkileşim kuvvet sabitleri göz önüne alınarak seküler denklemler oluşturulur. Bununla birlikte, yöntemin bazı metal karbonillere uygulanmasında iki önemli sorunla karşılaşılır. Bunlardan biri C-O gerilme bandlarının simetrik etiketlenmesidir. Diğeri ise seküler denklemlerinin çözümünde ortaya çıkmaktadır. Çünkü gözlenen C-O gerilme bandlarının sayısı, bilinmeyen (kuvvet sabitleri) sayısından daha azdır. Böyle bir durumda, matematiksel olarak, seküler denklemlerin sonsuz sayıda çözümü olacağı açıktır. Geçerli bir çözümü elde etmek için çeşitli yaklaşık yöntemler önerilmiştir. Ancak bu yöntemlerden bazılarının uygulaması oldukça zor, bazılarının da deneysel verilerle yeterince uyum içinde olmaması gibi dezavantajları vardır. Bu çalışmada, Fe2(CO)4(?5-C5H5)2 kompleksininin 13C-izotopomerlerinin karbonil gerilme bölgesindeki titreşim spektrumlarının analizi yapılmıştır. Anahtar kelimeler: Metal karboniller, infrared spektrumu, CO-ayırımlı kuvvet alanları yöntemi, kuvvet sabiti.Öğe Optoelectronic and electric properties of 8?Hydroxyquinoline-Based complexes with divalent metal ions(Elseiver, 01.04.2022) Üngördü, AyhanFirstly, the metallic complexes containing 8‐hydroxyquinoline were designed theoretically to investigate their optoelectronic properties (M = Sc2+, Ti2+, V2+, Cr2+, Mn2+, Fe2+, Co2+, Ni2+, Cu2+, Zn2+ Pd2+, and Pt2+ and Q: 8‐Hydroxyquinoline). Monomer calculations were executed at B3LYP/6-31G(d) level in Gaussian 16 program and LANL2DZ basis set was used only for Pd and Pt metals. On the other hand, dimer calculations were performed at B3LYP/TZP level by Amsterdam Density Functional (ADF) 2019 software. Using quantum chemical parameters, the optoelectronic behavior of the complexes was estimated and the best for devices such as the organic light emitting diode (OLED) structure was proposed. Secondly, the transport properties of the mentioned complexes are determined by nonequilibrium Green's function (NEGF) method based on the combination DFT in QuantumATK 2018 software. With this technique, the I–V characteristics and the transmission spectra of the investigated complexes is calculated and analyzed in range of 0–2 bias voltage. From the NEGF results, it is found that the best and the worst conductor complex in this voltage range and the best candidate for electronic devices like nanowires is suggested. The compounds studied in this study are considered as excellent candidates for next-generation optoelectronic and electronic devices.Öğe Structural, spectral, biological and antioxidant analyses of baicalin and ıts vanadium complexes: a dft study(2020) Sayın, Koray; Üngördü, AyhanMolecular simulation analyses of baicalin and its vanadium complexes were done at B3LYP/6-31+G(d) and B3LYP/ANL2DZ levels, respectively. The conformer analyses were performedfor baicalin and the most stable one is determined at OPLS3e method by using Maestro 11.9program. Structural and spectral analyses of the baicalin – vanadium complex is performed ingas phase and water. Potential energy distribution (PED) analyses were done to evaluate theinfrared (IR) spectra. 1H- and 13C-NMR spectra of V (IV) complex are analyzed. Finally,biological reactivity of related compounds is compared with that of cisplatin by using quantumchemical descriptors (QCD). Antioxidant properties of related structures are compared witheach other by using same QCDs. According to QCD rankings, antioxidant activity of baicalinis increased with the complexing of studied ligand.
