Yazar "Kabak, Gonca" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Allium Polyanthum Schult Ekstraktı ve Dosetakselin Kolorektal Kanser Hücrelerindeki Apoptozla İlgili Genler Üzerindeki Sinerjik Etkisinin Araştırılması
    (Sivas Cumhuriyet Üniversitesi, 2024) Tunçbilek, Zuhal; Kabak, Gonca; Siliğ, Yavuz
    Amaç: Kolorektal kanser (CRC), yüksek mortalite ve yaygın metastazlı bir kanser türüdür. CRC'nin erken teşhis edildiği durumlarda kemoterapi ve cerrahi uygulamalar esastır. Docetaxel, taksan grubunda bir antikanser ajandır. Ayrıca, tıbbi aktiviteye sahip bitkilerin CRC üzerinde koruyucu bir etkiye sahip olduğu bilinmektedir. Amaç, Allium polyanthum Schult bitki özütü ve bu bitki özütünün dosetaksel ile kombinasyonu ile tedavi edilen kolorektal kanser hücrelerinde apoptozisle ilişkili genlerin ifade düzeylerini belirlemekti. Gereç ve Yöntem: Sadece Allium polyanthum Schult bitki ekstresi ve bu bitki ekstresiyle birlikte docetaxel uygulanan CRC hücre hattı HT-29 ve sağlıklı kolon hücre hattı CCD-18Co'da apoptozda rol oynayan kaspaz-2 (CASP2), nükleer faktör NF-kappa-B1 (NFKB1), apoptoz düzenleyici BAX ve proto-onkogen MYC genlerinin ekspresyon analizleri, gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) yöntemi kullanılarak gerçekleştirildi. Çeşitli veritabanları kullanılarak ilgili genlerin biyoinfarmatik analizi gerçekleştirildi. Sonuçlar: CASP2, MYC, NFKB1 ve BAX gen ekspresyonu, Allium polyanthum Schult özütü ve docetaxel kombinasyonu ile tedavi edilen CRC hücrelerinde sağlıklı hücrelere kıyasla önemli ölçüde azaldı. Biyoenformatik analiz sonucunda, CASP2, MYC, NFKB1 ve BAX proteinlerinin birbirleriyle etkileşime girdiği ve genlerinin ekspresyon seviyelerinin hayatta kalma ile ilişkili olduğu bulundu. Ayrıca, CASP2 ve NFKB1'in metilasyon durumu, CRC'de epigenetik mekanizmaları etkileyerek protein seviyelerini değiştirme potansiyeline sahiptir. Tartışma: Literatürdeki bilgilere göre, Allium türlerinin apoptotik yollardaki genleri etkilediği bildirilmiştir. Buna göre, Allium polyanthum Schult'un tek başına ve docetaksel ile kombinasyonu daha fazla çalışma ile desteklenmelidir.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Kolon kanseri hücrelerinde PDL-1 geninin susturulmasının dna tamir mekanızması üzerine etkisinin araştırılması
    (Sivas Cumhuriyet Üniversitesi, 2024) Kabak, Gonca; Siliğ, Yavuz
    PD-L1, bağışıklık sisteminin tümör hücrelerini tanımasını engelleyerek immün kaçışa katkıda bulunur. Aynı zamanda kanser hücrelerinde DNA hasar onarımı süreçlerine etki edebileceği düşünülmektedir. Bu çalışmada, PD-L1 geni susturulmuş kolon kanseri hücre hattı HT-29 ve sağlıklı kolon epitel CCDCo-18 hücre hatlarında, DNA tamir mekanizmasında görev alan ATR, CDKN1A, ERCC1, RAD51 genlerinin ekspresyon düzeylerinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmamızın başlangıcında DNA tamir mekanizmasında görev alan proteinlerin birbirleriyle ve PD-L1 proteini ile etkileşimini belirlemek için String database v11 programı kullanıldı. Analiz sonucunda PD-L1 proteinin, ATR, CDKN1A, ERCC1, RAD51 proteinleriyle etkileşimleri belirlendi. Sonra hücre hatlarında siRNA yardımıyla PD-L1 geni susturuldu. PD-L1 geni susturulan HT-29 ve CCDCo-18 hücre hatlarından kit protokolüne uygun olarak RNA izole edildi. Elde edilen RNA'lardan yine kit protokolüne göre cDNA sentezlendi. RT-PCR cihazında 2- ∆∆CT yöntemi kullanılarak gen ekspresyonu analizi gerçekleştirildi. PD-L1 geni susturulan hücrelerde susturma düzeyleri %90'ın üstünde olacak şekilde RT-PCR ile belirlendi. Susturma işlemini takiben cDNA örneklerinde belirlenen DNA tamir genlerinin ekspresyon düzeyleri ölçüldü. Sonuç olarak, kolon kanseri hücre hattında PD-L1, ATR, CDKN1A genlerinin ekspresyonunun kontrol grubuna kıyasla azaldığı ve ERCC1, RAD51 genlerinin ekspresyonunun ise kontrol grubuna kıyasla arttığı tespit edilmiştir. Sağlıklı kolon epitel hücrelerinde bu durum; PD-L1, ERCC1, ATR genlerinin ekspresyonu kontrol grubuna kıyasla azaldığı ve RAD51 ve CDKN1A'in ise arttığı tespit edilmiştir.