Yazar "Karakodak, Nurşen" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 3 / 3
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe BSA/DNA binding behavior and the photophysicochemical properties of novel water soluble zinc (II) phthalocyanines directly substituted with piperazine groups(2021/6) Khezami, Khaoula; Harmandar, Kevser; Bağda, Esra; Bağda, Efkan; Şahin, Gamze; Karakodak, Nurşen; Durmuş, MahmutIn the current research, two novel zinc(II) phthalocyanines (ZnPcs) (1 and 2) directly connecting with 4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl groups have been synthesized through the Suzuki–Miyaura coupling reaction. These ZnPcs 1 and 2 were converted to their water-soluble derivatives (1Q and 2Q) by quaternization. The photochemical and photophysical properties were determined in DMSO for the non-ionic zinc(II) phthalocyanines (1 and 2) and in both DMSO and aqueous solutions for the quaternized cationic derivatives (1Q and 2Q) to establish their photosensitizer capabilities in photodynamic therapy (PDT). The spectrofluorometric and spectrophotometric techniques were employed for the determination of interaction between water-soluble ZnPcs (1Q and 2Q) and BSA or ct-DNA. The binding constants of these compounds to BSA were found in the order of 108 M−1. The binding constant of the ct-DNA interaction with 2Q (1.09 × 105 M−1) was found higher than 1Q (6.87 × 104 M−1). The thermodynamic constants were determined for both 1Q and 2Q. The endothermic and spontaneous nature of interaction was observed with ct-DNA. Besides, the thermal denaturation and viscosity studies proved the non-intercalative mode of binding for both compounds to ct-DNA.Öğe BSA/DNA binding behavior and the photophysicochemical properties of novel water soluble zinc (II) phthalocyanines directly substituted with piperazine groups(Springer, 2021/05/04) Bağda, Efkan; Harmandar, Kevser; Bağda, Esra; Şahin, Gamze; Karakodak, Nurşen; Durmuş, Mahmut; Khezami, KhaoulaIn the current research, two novel zinc(II) phthalocyanines (ZnPcs) (1 and 2) directly connecting with 4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl groups have been synthesized through the Suzuki–Miyaura coupling reaction. These ZnPcs 1 and 2 were converted to their water-soluble derivatives (1Q and 2Q) by quaternization. The photochemical and photophysical properties were determined in DMSO for the non-ionic zinc(II) phthalocyanines (1 and 2) and in both DMSO and aqueous solutions for the quaternized cationic derivatives (1Q and 2Q) to establish their photosensitizer capabilities in photodynamic therapy (PDT). The spectrofluorometric and spectrophotometric techniques were employed for the determination of interaction between water-soluble ZnPcs (1Q and 2Q) and BSA or ct-DNA. The binding constants of these compounds to BSA were found in the order of 108 M−1. The binding constant of the ct-DNA interaction with 2Q (1.09 × 105 M−1) was found higher than 1Q (6.87 × 104 M−1). The thermodynamic constants were determined for both 1Q and 2Q. The endothermic and spontaneous nature of interaction was observed with ct-DNA. Besides, the thermal denaturation and viscosity studies proved the non-intercalative mode of binding for both compounds to ct-DNA.Öğe Morfolin ve piperazin grupları içeren suda çözünür çinko ftalosiyaninlerin dna etkileşimleri ve antimikrobiyal fotodinamik terapi uygulamaları(Sivas Cumhuriyet Üniversitesi, 2020) Karakodak, Nurşen; Bağda, EfkanEnfeksiyon hastalıkları, insan ölümlerinin nedenlerinden biri olarak hala ilk sıralarda yer almaktadır. Tedavide kullanılan antibiyotik ve antibiyotik türevlerine karşı son yıllarda hızla gelişen direnç bu hastalıklarla mücadeleyi zorlaştırmaktadır. Bu nedenle antimikrobiyal stratejiler geliştirmek zorunlu hale gelmiştir. Antimikrobiyal fotodinamik tedavi bakteriler, virüsler, mantarlar ve prion gibi patojenlerin neden olduğu geniş spektrumlu enfeksiyonların tedavisinde uygulanan nonivazif bir yaklaşımdır. Uygulama, mikroorganizmada hücre içi organelleri ve biyomolekülleri hasar yoluyla etkileyerek sitotoksik etki meydana getirmektedir. Bu yöntemde fotoduyarlaştırcı bir bileşiğin uygun dalga boyundaki bir ışıkla uyarılması sonucu oksidatif hasar oluşturularak (reaktif oksijen türleri (ROT) ve/veya tekil oksijen ile) mikroorganizma hücrelerinin öldürülmesi hedeflenmektedir. Bu yaklaşım direnç gelişimine yol açmaz ve kısa süreli tedavi sunar. Son yıllarda antibiyotik direnç sorununa farklı bir çözüm olarak gösterilen antimikrobiyal fotodinamik tedaviye olan ilgi artmış ve enfeksiyonların tedavisinde kullanılabilecek yeni fotoduyarlaştırıcı ilaç arayışları hız kazanmıştır. Bu kapsamda, yapılan bu tez çalışması ile morfolin ve piperazin grupları içeren suda çözünür çinko ftalosiyanin bileşiklerinin DNA etkileşimleri ile antimikrobiyal fotodinamik terapi etkinlikleri araştırılmıştır. viii Çalışmanın ilk aşamasında Fs bileşiklerinin ct-DNA ve plazmid DNA ile etkileşimleri Uv-Gör., floresans spektroskopi ve jel elektroforez yöntemleri ile çalışılmıştır. Her iki bileşiğinde ct-DNA ile oluklara bağlanma şeklinde etkileştiği belirlenmiştir. Uv-Gör. Spektofotometrik titrasyon sonucunda sonucunda ct-DNA, Kb bağlanma sabiti Fs 1 için 6,3x104 M-1, Fs 2 için ise 6,87x104 M-1 olarak belirlendi. Çalışılan Fs bileşiklerinin plazmid DNA ile olan etkileşimlerinin ihmal edilebilir sevide olduğu görülmüştür. Çalışmanın ikinci aşamasında ise; Fs bileşiklerinin AFDT etkinlikleri Pseudomonas aeruginosa (ATCC-27853), Staphylococcus aureus (ATCC-29213) ve Candida albicans (ATCC-10231) organizmaları ve diyot lazer ışık kaynağı (635 nm) kullanılarak araştırılmıştır. 1,1 mM'da sitotoksik olduğu belirlenen Fs 1 bileşiğinin 250 J/cm2'de 1 mM derişimde sitotoksik etki göstermediği gözlenmiştir. Bu sonuç, Fs 1 bileşiğinin tek başına sitotoksik olduğu ve geniş spektrumlu antimikrobiyal ajan olarak kullanılabilme potansiyelinin yüksek olduğunu işaret etmektedir. Fs 2 bileşiğinin ise 250 J/cm2 ışık şidddetinde; S. aureus için 62,5 ?M, P. aeruginosa 600 ?M ve C. albicans 500 ?M derişimlerinde sitotoksik olduğu. Bu durum, Fs 2 bileşiğinin geniş spektrumlu AFDT ajanı olarak kullanılabilme potansiyelini gösterdi. Anahtar Kelimeler: DNA Etkileşimi, Ftalosiyanin, Antimikrobiyal Fotodinamik Terapi
