Yazar "Koç, Emre" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • Küçük Resim
    Öğe
    Antioxidant activities of Alyssum virgatum plant and its main components
    (Springer, 01.02.2022) Koç, Emre; Üngördü, Ayhan; Candan, Ferda
    The antioxidant properties of methanol extract of above-ground parts of Alyssum virgatum, an endemic plant, were analyzed. Together with their total phenolic, flavonoid, and antioxidant capacities, their effects on reactive oxygen species were determined by experimental methods. The methanol extracts of A. virgatum plant appeared to exhibit in-vitro antioxidant activity. In particular, the extract of the plant was found to have a scavenging effect against hydrogen peroxide and hydroxyl radical. Total phenolic content was found to be 161.25 mg gallic acid per gram dry material. Total flavonoid content was found to be 119.89 mg quercetin per gram dry material. Total antioxidant capacity was determined as 94.92 mM α-tocopherol acetate per gram dry material. Moreover, the amount of the extract that caused 50% inhibition of hydrogen peroxide and hydroxyl radical was assayed as 29.24 mg mL− 1 and 46.04 mg mL− 1, respectively. Addition to the experimental studies, DFT, molecular docking, and ADME calculations were performed to determine antioxidant, biological activity, and drug properties of two main phenolic components of A. virgatum which are cinnamic acid and ferulic acid. DFT calculations were executed at B3LYP/6–311 + + G(d,p) level in Gaussian 16 software. The HAT, SET-PT, SPLET mechanisms, and the spin density analyses of the main components were investigated in detail. Molecular docking studies of the investigated main components were executed on the antioxidant proteins in Schrodinger 2020–3 program. Additionally, ADME properties of the mentioned main components were determined via QikProp module in the Schrodinger software. All theoretical studies showed that ferulic acid had better antioxidant, biological, and drug activities than cinnamic acid.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Bazı salvia türlerinin, reaktif oksijen türlerini temizleme özelliği ve antihemolitik etkisi
    (Cumhuriyet Üniversitesi, 2014) Koç, Emre; Candan, Ferda
    Bu çalışmada Salvia euphratica subsp. euphratica Montbret & Aucher ex Bentham, Salvia candidissima subsp. candidissima Montbret & Aucher ex Bentham ve Salvia russellii bitkilerinin metanol özütleri üzerinde toplam fenol, toplam flavanoid ve toplam antioksidan kapasitesi araştırıldı. Bunun yanı sıra süperoksit, hidroksil, ve hidrojen peroksit gibi farklı reaktif oksijen türlerini temizleme özelliği ile birlikte antihemolitik etkisi çalışıldı. Her bir bitki özütleri için toplam fenol, flavanoid ve antioksidan aktiviteleri incelendiğinde; toplam fenol ve toplam flavanoid miktarları ile toplam antioksidan aktivitesinin Salvia candidissima, Salvia euphratica ve Salvia russellii sıralamasıyla arttığı bulundu. Bitki metanol özütlerinin reaktif oksijen türlerini inhibe etmede etkin oldukları ve hidrojen peroksit, hidroksil ve süperoksit radikalini temizledikleri bulundu. Hidrojen peroksit temizlemede aktivitenin Salvia euphratica, Salvia candidissima ve Salvia russellii sıralamasıyla arttığı gözlendi. Ancak hidroksil ve süperoksit radikalini inhibe etmede Salvia candidissima, Salvia euphratica ve Salvia russellii sıralamasıyla arttığı görüldü. Ayrıca bitki özütlerinin hidrojen peroksit temizleme özelliğindeki sıralama ile antihemolitik etki gösterdikleri bulundu.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Chelon auratus (Risso, 1810)’un Karaciğerinden Glukoz-6-Fosfat Dehidrojenaz’ın Saflaştırılması ve Kinetik Karakterizasyonu
    (2021) Görgün, Salih; Koç, Emre
    Bu çalışmada, önemli bir kefal balığı türü olan Chelon auratus (Risso, 1810)’un karaciğerinden glukoz-6-fosfat dehidrojenaz (EC\r1.1.1.49), 2?5? ADP-Sepharose 4B afinite kromatografisi ile 252 kat saflık, 27.04 EU/mg.protein spesifik aktivite ve % 27.42 verim\rile saflaştırılmıştır. Elde edilen enzim preparatı için optimum sıcaklık, pH ve iyonik güç sırasıyla 40 ºC, pH 8, ve 0.1 M olarak\rbulunmuştur. Enzimin kinetik davranışı gerek glukoz-6-fosfat (G6P) gerekse NADP+ için değerlendirilmiştir. Elde edilen verilere\rgöre, Km ve Vmax değerleri NADP+ için sırasıyla 0.14 mM ve 3.40 EU/mL olarak belirlenirken, G6P için sırasıyla 0.23 mM ve 2.62\rEU/mL olduğu bulunmuştur. Bu veriler, substrat olarak G6P ile karşılaştırıldığında, enzimin NADP+ için daha yüksek bir afinite\rsergilediğini önermektedir. Saflaştırılan enzim preparatında SDS-PAGE analizi sonucunda, molekül kütlelerinin yaklaşık olarak 108\rkDa ve 60 kDa olan iki protein bandının olduğu görülmüştür. Elde edilen sonuçlar, kefal türlerinden glukoz-6-fosfat dehidrojenazın\rsaflaştırılmasında ek kromatografik adımların gerekli olduğunu önermektedir.