Yazar "Korkmaz, Özge" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Ateroskleroz hastalarının Koroner Arter plaklarında uzun kodlama yapmayan RNA’ ların (lncRNAs) ifade düzeylerinin araştırılması
    (2016) Arslan, Serdal; Berkan, Öcal; Korkmaz, Özge; Göksel, Sabahattin; Çetin, Nilgün
    Koroner arter hastalığı dünyadaki ölümlerin önde gelen sebebini oluşturan yaygın kompleks bir hastalıktır. Koroner arter hastalığının en yaygın sebebi koroner arterlerdeki aterosklerozdur. Ateroskleroz damar duvarının yaralanmasına cevap olarak gelişen kronik inflamatuar bir hastalık olarak kabul edilir. Ateroskleroz Türkiye? deki ölümlerin de %40? ını oluştururken, 65 yaş üstü Avrupalı erkeklerde birincil ölüm nedeni kadınlarda ise ikincil ölüm nedeni olmaktadır. Kodlama yapmayan RNA aracılı epigenetik düzenlemeler uzun kodlama yapmayan RNA?lar (Long noncodingRNA, lncRNA) ve kısa kodlama yapmayan RNA?lar tarafından gerçekleştirilir. lncRNA? ların gen düzenleme mekanizmaları hem gen ekspresyonunun aktivasyonu hem de inhibisyonu içermesi açısından daha kompleks bir yapıya sahiptir. Bu çalışmada dünyada ilk defa ateroskleroz hastalarının koroner arter plaklarında bazı uzun kodlama yapmayan RNA?ların ifade düzeyleri araştırılmıştır. Son yıllarda yapılan klinik çalışmalarda internal mamalial arter greftlerinin bugün için koroner arter bypass cerrahisinde ideal greftlere en yakın greft olduğu belirlenmiştir. Bu çalışmada koroner arter by-pass cerrahisi sırasında aterosklerotik koroner arter ve internal mamalial arterden alınan doku örnekleri kullanılmıştır. Total RNA doku örneklerinin homojenizasyonundan sonra izole edilmiştir. Doku örneklerinde beş adet uzun kodlama yapmayan RNA?ların ifade düzeyleri RT-PCR kullanılarak ölçülmüştür. Mevcut çalışmada kardiyak patolojiyle ilişkili olduğundan şüphelenilen beş adet uzun kodlama yapmayan RNA araştırılmıştır. Bu lncRNA? lar hipoksi indüklenebilen faktör 1A antisens RNA 2 (aHIF2), siklin bağımlı kinaz inhibitör 2B antisens RNA 1 (ANRIL), Potasyum voltaj-kapılı kanal, KQTbenzeri alt familyası,üye1 ters zincir/antisens transkript 1 (KCNQ1OT1), MI-İlişkili transkript (MIAT) ve Metastaz ilişkili akciğer adenokarsinom transkript 1 (MALAT1) dır. Bu çalışmada aterosklerotik koroner arter ve aterosklerotik olmayan internal mamalial arter arasındaki uzun kodlama yapmayan RNA?ların ifade düzeyleri arasındaki farklılık karşılaştırılmıştır. ANRIL, MIAT,MALAT1 in koroner arter plaklarındaki ifade dağılımları internal mamalial arterdekine göre istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur. KCNQ ve HIF ın ifade dağılımları istatistiksel olarak anlamlı olmamakla birlikte kontrol grubuna göre iki genin ifadeside artmıştır. ANRIL, MIAT,MALAT1 in koroner arter plak gelişimi açısından belirteç olma özelliğindedir.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Aterosklerozlu hastalarda koroner arter ve internal mamarian arterlerin yapısal ve patolojik açıdan karşılaştırılması
    (2017) Berkan, Öcal; Eğilmez, Hatice Reyhan; Arslan, Serdal; Korkmaz, Özge; Çetin, Nilgün
    Koroner arter hastalığı dünyadaki ölümlerin önde gelen sebebini oluşturan yaygın kompleks bir hastalıktır. Koroner arter hastalığının en yaygın sebebi koroner arterlerdeki aterosklerozdur. Ateroskleroz damar duvarının yaralanmasına cevap olarak gelişen kronik inflamatuar bir hastalık olarak kabul edilir. Ateroskleroz Türkiye’ deki ölümlerin de %40’ ını oluştururken, 65 yaş üstü Avrupalı erkeklerde birincil ölüm nedeni kadınlarda ise ikincil ölüm nedeni olmaktadır. Kodlama yapmayan RNA aracılı epigenetik düzenlemeler uzun kodlama yapmayan RNA’lar ve kısa kodlama yapmayan RNA’lar (mikroRNA) tarafından gerçekleştirilir. Mikro RNA’lar 19-25 nükleotid uzunluğunda, mRNA stabilitesinin ve translasyonunun düzenlenmesinde görev alan kodlama yapmayan RNA’lardır. Mikro RNA lar aterosklerozun patogenezinde anahtar rol oynamaktadır. Bu çalışmada dünyada ilk defa ateroskleroz hastalarının koroner arter plaklarında bazı uzun kodlama yapmayan RNA’ların ifade düzeyleri araştırılmıştır. Çalışmamızda koroner bay-pass sırasında alınan koroner arter ve internal mamalial arterlerde patolojik incelemeler yapılmıştır. Dokular homojenize edilmiş ve RNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. Mikroarray ile mikro RNA ekspresyon çalışması için 2500 mi RNA için geliştirilmiş probu bulunan mir Base Ver 21 kullanılmıştır. Mikroarray ekspresyon sonuçları beş adet miRNA için RT-PCR ile doğrulanmıştır. MiRNA ekspresyon sonuçları Genespring (Ver 3.0) kullanarak analiz edilmiştir. Analiz sonucunda yalnız koroner arter plaklarına ifade olan 49 adet mi RNA bulunmuştur. Koroner arter ve internal mamalial arterlerde ifade olan mi RNA ların karşilaştırılması sonucu 32 adet miRNA istatistiksel olarak anlamlı ifade olduğu tespit edilmiştir (p?0.05). Bu 32 miRNA nın 15 adedi yukarı düzenlenmiş, 17 adedi ise aşağı düzenlenmiştir. Biyoinformatik analizlerle istatistiksel olarak önemli ifade olan miRNA ların hedef genleri bulunmuştur. Bu çalışma verileri, koroner arterlerdeki aterosklerotik sürecin, patolojik temelinde rol oynayan epigenetik mekanizmaların açıklanmasına katkı sağlayacaktır. Ayrıca, ilerde mikro RNA’lar kullanılarak geliştirilecek olan, aterosklerotik plak gelişimini önlemeye yönelik ilaçların geliştirilmesi sürecinde önemli bir veri kaynağı olacaktır.