Yazar "Serin, Musa" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Investigation of gene expression levels in thyroid tissues of rats treated with Wi-Fi electromagnetic wave (2.4-3 GHz Wi-Fi RF-EMF)
    (Elsevier, 2023) Serin, Musa; Soylu, Sinan; Dastan, Sevgi Durna; Koc, Suleyman; Kurt, Atilla
    In this study, it was aimed to examine the effects of wireless waves applied to rats in the thyroid tissue by evaluating gene expression levels on 12 determined gene regions. 20 healthy 16-week-old Wistar albino female rats weighting 200-220 g were used. In the experiments, two groups, control and experimental groups, were formed, and ten female rats were used in each group. While WI-FI electromagnetic field was applied to the experimental group of these rats, nothing was applied to the control group. Many different gene regions, including beta catenin, beta-actin, GAPDH, L3B, HIF 1-Alpha, GSk-3B, TCF, WNT7a, WNT10a, WNT2, Beclin 1 and Beclin 2, ATG5 and ATG12, were investigated. ACTB and GAPDH gene primers were used as a house keeping gene. The fold change values were calculated statistically from the data obtained from the gene expression re-sults. Compared to the control group, it was observed that the experimental group had significant increases in gene expression levels of many gene regions investigated in the study (P<0.05). Among the study groups, 12 different genes such as beta catenin, beta-actin, GAPDH, L3B, HIF 1-Alpha, GSk-3B, TCF, WNT7a, WNT10a, WNT2, Beclin 1 and Beclin 2, ATG5 and ATG12, which we have determined according to the literature, are known to be related to autophagy and oxidative stress. When the expression levels were investigated, it was determined that the expression coefficients of all the genes studied in the wnt/ss catenin pathway in the experimental group of rats exposed to the Wi-Fi EM field, except for ATG5 and ATG12, were quite high, and there was significant differences between the groups.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    WI-FI elektromanyetik dalga(WI-FI RF-EMF) uygulanmış ratların tiroid dokularında gen ekspresyonu seviyelerinin incelenmesi
    (Cumhuriyet Üniversitesi, 2022) Serin, Musa; Soylu, Sinan
    Bu çalışmada; ratlarda wireless uygulaması ile meydana gelen değişimlerin, tiroid dokularında bazı genlerin aktifleşen veya inaktive olan gen ifadesi parametrelerine yansımaları araştırılacaktır. Dolayısıyla bu çalışma kapsamında ratlara uygulanan wireless dalgalarının etkilerinin, tiroid dokusundaki çeşitli enzim düzeylerine yansımaları, total RNA miktarı ve belirlenmiş 12 gen bölgesi üzerindeki ekspresyon derecesi belirlenecektir. Bu analizler; son derece hassas ve güvenilir ölçüm yapabilen araştırma kitleri kullanılarak gerçekleştirilecektir. Sonuçta bu çalışmalardan elde edilen verilerin sunumu neticesinde bilim dünyasına katkı sağlaması beklenmektedir. Bu kapsamda, son derece orijinal, güvenilir ve hassas ölçümlerin kullanılacağı bu araştırmanın; bu alanda bundan sonra yapılacak olan birçok çalışma için de yol gösterici ve ışık tutucu olabileceği düşünülmektedir. Materyal Metod: 20 adet 16 haftalık 200-220 gr ağırlığında sağlıklı Wistar albino dişi rat kullanılmıştır. Deneylerde kontrol ve deney grubu olmak üzere, 2 grup hazırlanmıştır ve her bir grupta 10'ar dişi rat kullanılmıştır. Bu ratlardan deney grubuna WI-FI elektromanyetik alanı uygulanmış, kontrol grubuna uygulanmamıştır. Deney grubundaki ratlara evlerde, ofislerde kullanılan kablosuz internet cihazlarının en çok kullandığı 3 GHertz Elektromanyetik dalga uygulaması, 30 gün süresince günde 12 saat maruz kalacakları şekilde yapılmıştır. Kontrol grubundaki ratlar ise herhangi bir elektromanyetik ortama maruz kalmayacak şekilde 30 gün süresince Faraday Kafesi ortamında korunarak yaşatılmıştır. 30 günün sonunda ratlar sakrifiye edilmiş ve diseksiyon yapılarak, tiroid dokuları araştırmada kullanılmak üzere alınmıştır. Elde edilen örneklerin ?L`sinde kaç nanogram RNA olduğunu hesaplamak için ve saflık kontrolü yapmak için spektrofotmetrik ölçüm gerçekleştirildi ve konsantrasyon tayinleri yapıldı. Yaklaşık olarak her bir örnek için 20-40 ng aralığında total RNA olduğu görüldü. RNA iv saflığını doğrulamak için A260/280 oranı kullanıldı. Sonraki basamaklarda expresyon analizleri için kullanılabilecek nitelikte kalitede saf RNA' ların oranının 1.8 -2.2 arasında olmasına dikkat edildi. cDNA eldesi için WizScriptTM cDNA Synthesis Kit (South Korea) kullanıldı. Gen ekspresyon analizleri için Applied Biosystem Step One Plus real time PCR (USA) cihazı kullanıldı. Real Time qPCR aşamasında GeneAll Real Amp TM SYBR master mix (Seoul, Korea) kullanıldı. Sentezlenen cDNA örneklerinin kantitatif analizi için SYBR Green ve pasif referans boyası ROX kullanılarak, boyaların floresan ışıma özelliklerinden yararlanarak real-time PCR gerçekleştirildi. Bu tez çalışması kapsamında gen ifadelenmesi (ekspresyon) değerlerinin belirlenmesi amacıyla, Beta catenin-Axin, beta-aktin, GAPDH, GSk-3B, TCF, WNT7A, WNT10A, WNT2, Beclin 1 ve 2, ATG5 ve 12 olmak üzere çok sayıda farklı gen bölgesinin incelenmesi söz konusudur. Real Time qPCR aşamasında house keeping gen olarak ACTB geni primerleri kullanıldı. Reaksiyon tamamlandıktan sonra veriler kaydedilerek analizler gerçekleştirildi. Gen ekspresyon sonuçlarından elde edilen fold change değerlerine göre istatistiksel hesaplamalar yapıldı. Kontrol grubu ve deney grubu arasında her bir gen ifadelenme katsayısı arasında istatistiksel anlamlı farklılıkların olup olmadığı GraphPad-Prism programı ile değerlendirildi. Grupların normalite özellikleri, Shapiro-Wilk testi ve Kolmogorov- Smirnov testleri ile değerlendirildiğinde non parametrik test varsayımlarını yerine getirdiği belirlendiği için, gruplar arası karşılaştırmalar Mann-Whitney istatistiksel analiz testi ile yapıldı. P değerinin <0,05 olması anlamlı kabul edildi. Gen ifadelenme katsayıları arasında anlamlı farklılık bulunan gruplar *işareti ile işaretlendi. Farklılıkları en iyi ifade edebilmek için veriler GraphPad-Prism programında grafiklere dönüştürülerek sunuldu. Bulgular: Kontrol grubuna göre deney grubunun çalışmada araştırılan pek çok gen bakımından, gen ifadelenme değerlerinde ciddi yükselişler olduğu bulundu. Gruplar arasında gen ifadelenme değerleri bakımından bulunan farklılıkların istatistiksel bakımdan önemli olduğu belirlendi (P<0,05). Sonuç: Çalışma grupları arasında literatüre göre belirlemiş olduğumuz, otofaji ve oksidatif stresle ilgili olduğu bilinen Beta catenin-Axin, beta-aktin, GAPDH, GSk-3B, TCF, WNT7A, WNT10A, WNT2, Beclin 1-2 ve ATG5-12 gibi 12 farklı genin ifadelenme dereceleri araştırıldığında, Wi-Fi EM alanına maruz bırakılan deney grubu ratlarında wnt/ß katenin yolağındaki çalışılan ATG5 ve ATG12 dışındaki tüm genlerin ifadeleme v katsayılarının oldukça yüksek olduğu ve kontrol grubuna göre aralarında anlamlı farklılıklar bulunduğu tespit edilmiştir.