Genetic Diversity of Cyprinion macrostomus Heckel, 1843 (Teleostei: Cyprinidae) in Anatolia

Abstract

Bu çalışmada Anadolu’ daki Cyprinion macrostomus HECKEL, 1843, Cyprinion kais HECKEL, 1843 ve Carasobarbus chantrei SAUVAGE, 1882 örneklerinin filogenetik ve filocoğrafik akrabalıkları, mitokondriyal DNA Polimeraz Zincir Reaksiyonu-Restriksiyon Fragment Uzunluk Polimorfizmi (PCR-RFLP) yöntemi ve Nüklear DNA-ISSR tekniği kullanılarak araştırıldı. Mitokondriyal DNA’nın PCR yöntemiyle çoğaltılan NADH ¾ dehidrojenaz (ND-3/4) gen bölgesi, 14 farklı restriksiyon enzimiyle kesildi ve bunun sonucunda çalışmamızdaki tüm populasyonlar için 14 farklı kompozit haplotip ortaya çıktı. Buradaki tüm tanımlanmış mtDNA haplotipleri sahip oldukları spesifik genetik profilleriyle birbirlerinden ayrılmaktadır. Ve PCR-RFLP verilerine göre, Akdeniz havzasından toplanan balık populasyonlarında ortaya çıkan mtDNA haplotipleri arasındaki genetik çeşitlilik, örneklerin toplandığı su havzalarının jeolojik tarihiyle de benzerlik göstermektedir. Nitekim Fırat-Dicle nehir sisteminin Asi nehrinden ve Akdeniz havzasındaki diğer nehirlerden daha erken dönemlerde izole olduğunu göstermektedir. Genel olarak mtDNA ve nDNA verileri birbiriyle uyumlu gözükmektedir.

In this study, the phylogenetic and phylogeographic relationships among Cyprinion macrostomus HECKEL, 1843, Cyprinion kais HECKEL, 1843 and Carasobarbus chantrei SAUVAGE, 1882 samples from Anatolia was analysed. While doing this, mitochondrial DNA polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and Nuclear DNA inter-simple sequence repeat (ISSR) were used. PCR amplified the complete mtDNA NADH ¾ dehydrogenase (ND-3/4) gene. Amplified fragment was digested by 14 restriction enzymes that produced 14 composite haplotypes for these populations. All identified mtDNA haplotypes differed from each other having a specific genetic profile. The genetic diversity among the mtDNA haplotypes of C. macrostomus, C. kais, and C. chantrei populations from drainage basins of the Mediterranean and those from the drainage basin of the Persian Gulf was purported by the extrapolation of mtDNA PCRRFLP data. This result is also supported by the data explaining the geological history of Anatolia. Broadly, the data from mtDNA and from nDNA was consistent.