Biyokimya Bölümü Kitap Koleksiyonu
Bu koleksiyon için kalıcı URI
Güncel Gönderiler
Öğe The Concepts of Epigenomics and Cell Epigenomes(Published by Nova Science Publishers, Inc. † New York, 2023) Taner Dastan; İnanç BaralAbstract Genetics cannot solely explain genetic variations in humans and disease developments. We see varying differences in phenotypes and disease susceptibility in organisms that have the same genetic make-up, e.g., monozygotic twins and cloned animals. The information carried by the genomic sequence is the blueprint, but the final product requires environmental determinants. Here comes the concept of epigenetics, as it is the framework where biochemical interactions between the genome and the environment blend. We can describe epigenetics as mechanisms that are beyond genetics, as such mechanisms alter the result of the genomic blueprint without altering the information itself, i.e., the sequence. Both epigenetics and epigenomics are trending research fields to better evaluate the genotype and the phenotype. The methylation of genetic material is a well-studied and well-known epigenetic marker. The epigenome, as a term, describes the inheritable changes in both the DNA and histone molecular structures, where the methylation and acetylation mechanisms are studied extensively. As the building blocks of the chromatin structure, nucleosomes depend on epigenetic changes, which lead to becoming either tight or loose, based on the particular mechanisms. Chromatin structure changes directly affect the gene expression, e.g., particular gene expression becomes silenced if the gene position has DNA hypermethylation and histone hypoacetylation that leads to the condensed form of the chromatin. Inversely, if the said changes were removed, genes in that position would express themselves again. Therefore, epigenetics provides a vigorous and remarkably malleable means for gene expression regulations. Epigenomics includes both the epigenetic mechanisms on the DNA and histones and complicated interactions between the genotype and the phenotype. There are well-known epigenomic changes in DNA, RNA, and protein levels. DNA base changes in somatic cells and chromosome positioning are among the aspects determining the epigenomic scene. Alternative splicing mechanism, RNA processing (editing, capping, Poly-A tailing, etc.), RNA methylation, and regulations conferred by the non-coding RNAs (ncRNAs) are RNA level epigenomic changes. Epigenomic changes at the protein level include various mechanisms of the post-translational modification.Öğe TRANSGENİK BİTKİ TÜRLERİ İÇİN İLGİLİ KARAKTER VE GENLER: İŞARET GENLERİ VE PROMOTÖRLER(L,vre de Lyon, 2023) İnanç Baral; Taner DastanTransgenik bitki araştırmaları, istenen özellikleri kazandırmak için bitki türlerine yeni genlerin eklenmesini mümkün kılarak tarım alanında devrim yapmıştır. Bu bölümde transgenik bitki araştırmalarının temel yönlerine genel bir bakış sunulmuş ve özellikle promotor ve işaretçi genlerin kullanımına odaklanılmıştır. Promotorlar, gen ifadesini düzenlemede kritik bir rol oynar ve bitkilerin dokuya özgü ifadesi, uyarılabilir gen düzenlemesi ve transgenik bitkilerde artan stres toleransı sağlamak için farklı tipte promotorlar, örneğin floem özgül promotorlar, stres uyarılabilir promotorlar ve RuBisCo küçük alt birim promotorları gibi birçok tür kullanılmıştır. Neomisin fosfotransferaz II (nptII), yeşil floresan protein (GFP) ve β-glukuronidaz (GUS) gibi işaretçi genler, transgenik bitkilerin tanımlanması, seçilmesi ve karakterize edilmesinde önemli rol oynamıştır. Bu işaretçi genler, gen ifadesi desenlerinin, dokuya özgü ifadesinin ve hücresel lokalizasyonun izlenmesini kolaylaştırmıştır. Ayrıca, çevresel riskleri azaltma ve düzenleyici onayı kolaylaştırma konularıyla ilgili endişeleri ele almak için seçilebilir işaretçi genlerin varlığı ile ilgili alternatifler olarak, işaretçisiz stratejiler ortaya çıkmıştır. Cre/lox veya FLP/FRT gibi site özgü rekombinasyon sistemlerini kullanarak, işaretçisiz transgenik bitkiler oluşturulabilir, çevresel riskleri azaltabilir ve düzenleyici onayı kolaylaştırabilir. Promotor ve işaretçi genlerin birleşimi, transgenik bitki araştırmalarını önemli ölçüde ilerletmiştir, böylece artan stres toleransı, daha iyi böcek direnci ve artmış verim gibi iyileştirilmiş özelliklere sahip genetik olarak değiştirilmiş ürünlerin geliştirilmesini mümkün kılmıştır.Öğe SARS-CoV-2 TEDAVİSİNDE İMMÜN SİSTEMİN DESTEKLENMESİ(Eğitim Yayınevi, 2022) Demet BAYBAŞBu çalışma, SARS-CoV-2 enfeksiyonunun tedavisi ve önlenmesi için güncel durumda uygulanan ilaç tedavilerinin yanı sıra bağışıklık sisteminde önemli işlevleri olduğu bilinen bazı vitamin ve minerallerin etkilerini inceleyen örnek makalelerin derlemesidir. Diğer derlemelerden en önemli farkı, bir Biyokimya Bölümü Lisans öğrencisinin bilimsel makalelere olan bakışını içermesidir. Çalışmada COVID-19 salgını, vitamin ve mineraller ile ilgili genel bilgiler de mevcuttur. Ayrıca, çalışma Kasım 2021’e kadar yayınlanan makaleleri içeren en kapsamlı Türkçe derlemedir. Derlemede, önce COVID-19 enfeksiyonu ile ilgili genel bilgilerden, daha sonra vitaminlerin ve minerallerin (Zn, Fe, Se) viral enfeksiyonlar üzerindeki etkilerinden bahsedilecektir. Her bölümün içinde ilgili vitamin ve mineralin COVID-19 üzerine etkilerini içeren güncel makaleler ve sonuçların yer aldığı tablolar bulunmaktadır.Öğe Epigenetics: Beyond the genetics and Medicine(nova science publishers, 2022) Daştan, TanerGenetics cannot solely explain genetic variations in humans and disease developments. We see varying differences in phenotypes and disease susceptibility in organisms that have the same genetic make-up, e.g., monozygotic twins and cloned animals. The information carried by the genomic sequence is the blueprint, but the final product requires environmental determinants. Here comes the concept of epigenetics, as it is the framework where biochemical interactions between the genome and the environment blend. We can describe epigenetics as mechanisms that are beyond genetics, as such mechanisms alter the result of the genomic blueprint without altering the information itself, i.e., the sequence. Both epigenetics and epigenomics are trending research fields to better evaluate the genotype and the phenotype. The methylation of genetic material is a well-studied and well-known epigenetic marker.Öğe biosensors(crc press taylor and francis, 2022) Daştan, TanerIt is our immense pleasure to introduce the book titled ‘Materials Development and Processing for Biomedical Applications’. This book is mainly focused on various methods of manufacturing, surface modifications, and advancements in biomedical applications for all kinds of readers. In particular, the fundamental aspects are discussed for a better understanding of the processing of various biomedical materials such as metals, ceramics, polymers, composites, etc. Besides, advancements in various fields of biomedical applications are emphasized. The book is basically focusing on five different aspects such as materials properties, development, processing, surface coatings, and future perspectives of advanced biomedical device fabrications. The development and applicationsÖğe cytokines and inflammation(nova science publishers, 2022) Daştan, TanerCytokines and Diseases will contribute to the pathogenesis, follow-up, and treatment processes of different clinical pictures and diseases in the light of current information obtained from the literature. This book aims to describe the type, effects, and kinetics of cytokine production, as well as to summarize the pathophysiology of the cytokine storm that occurs after bacterial sepsis or severe viral infection. It has been a summative review containing the most up-to-date data for academics participating in cytokine-based therapy studies, studies targeting cytokine production or effects, and clinical trials that arouse interest after the Covid-19 pandemic.Öğe DENTAL ANKSİYETE YÖNETİMİ – AROMATERAPİ(Gece Kitaplığı / Gece Publishing, ŞUBAT 2021) Candan Merve; Candan FerdaDental anksiyete, özellikle çocukların dental tedavi sırasında diş hekiminin ve ebeveynlerin zorlanmasına neden olan en yaygın faktördür. Fakat her yaştan erişkinleri de etkileyebilir. Hem diş hekimliğinde hem de tıpta, hastaları rahat bir şekilde tedavi edebilmek için hastanın anksiyetesini önlemek gerekmektedir. Hastayla empati kurma, doğru yaklaşım ve alternatif tedaviler, anksiyolitik ilaçların akıllıca kullanılması, sedasyon ve genel anestezinin yalnızca ciddi durumlarda tercih edilmesini sağlar. Hastanın anksiyetesi, diş hekimleri ve personelleri için önemli yönetim sorunlarını ortaya çıkarır ve endişeli bir hasta, daha uzun tedavi süresi ve tedavisi için daha fazla sayıda randevu gerektirirÖğe Chemistry, Biochemistry and Autoimmunity(Cambridge Scholars Publishing, 2021) Daştan, TanerMany mechanisms, molecular and cellular events, and responses are interferenced under autoimmunity. The dynamic biological system formed by the realization of the laws of the sciences of chemistry and physics is constantly in motion in maintaining metabolic activities in the body, in the fight against foreign molecules, in the formation of the immune response, and in the realization of autoimmune reactions. The formation of the immune response in living systems, the synthesis and interactions of molecules that occur during the immune response, and even the molecules that cause the immune response are all regulated with biological reactions maintained by chemical mechanisms.
