Kırım Kongo Kanamalı Ateşi Hastalarında Uzun Kodlama Yapmayan RNA İfade Düzeylerinin Araştırılması

Kırım Kongo Kanamalı Ateşi (KKKA), özellikle Türkiye başta olmak üzere dünyada en yaygın görülen ve yüksek ateş, baş ağrısı, baş dönmesi, sırt ve karın ağrısıyla karakterize arboviral, zoonotik bir infeksiyondur. KKKA'nın etkeni Bunyaviridae ailesinin Nairovirus cinsine ait Kırım Kongo kanamalı ateşi virüsü (KKKAV) dür ve Hyalomma cinsindeki kenelerle taşınır. Uzun kodlama yapmayan RNA'lar (lncRNA'lar) genellikle 200 nükleotitten daha uzun gen ekspresyon düzenleyicileridir. Viral infeksiyonlar lncRNA?ların da içinde olduğu hücre transkriptomunda güçlü değişiklikler meydana getirir. Enfekte olmuş hücrelerde eksprese olan bazı lncRNA'lar viral ve konak genlerinin ekspresyonunu düzenlemede kullanılır. Hücresel lncRNA'ların ekspresyonu antiviral cevabı değiştirebilir. Bazı lncRNA'lar virüs replikasyonuna yardımcı olur, sitozolik sürveyanstan kurtulmayı sağlar ve antiviral bağışıklığın azalmasına neden olurlar. Son yıllarda lncRNA?ların hastalık ilerlemesinde prognostik belirteçler ve tedaviye yönelik hedefler olabileceği düşünülmektedir. Bizim çalışmamızda dünyada ilk defa KKKAV ile enfekte olmuş bireylerde mikroarray yöntemi kullanılarak lncRNA gen ekspresyon profilleri araştırılmıştır. Tüm kan örneklerinden PAXgene Blood RNA Kit kullanılarak total RNA izole edildi. MirBase Ver 21 (Agilent Teknolojisi) kullanılarak mikroarray analizi yapıldı. LncRNA ekspresyon sonuçları Genespring (Ver 3.0) kullanılarak analiz edildi. Bulgularımız 39 adet lncRNA ekspresyonunun kontrol grubuna göre hasta grubunda istatistiksel olarak anlamlı olduğunu gösterdi. Hasta grubunda 34 lncRNA?nın yukarı yönlü, 5 lncRNA'nın ise aşağı doğru düzenlendiği bulundu. Ayrıca KKKA hastalığından dolayı ölen bireylerle sağlıklı bireyler karşılaştrıldığında ise 112 lncRNA ekspresyon değişimi istatistiksel olarak önemli bulundu. Ölen hastalarda 101 adet lncRNA ekspresyonu aşağı yönlü düzenlenirken 11 det lncRNA yukarı yönde ifade olmuştur. Bu çalışmadan elde edilen sonuçlar KKKA patogenezinde lncRNA'ların rolünü anlamamıza katkı sağlayacaktır. İlaveten, bu çalışmanın sonuçlarından elde edilecek verilerin, gelecekte lncRNA'ların kullanımıyla KKKA infeksiyonuna karşı lncRNA'ya antisens ya da lncRNA benzeri oligonükleotit temelli tedavi geliştirilmesi için bir veri kaynağı olması mümkündür.